Cytoscape是一款开源生物网络复杂关系网络可视化与分析平台，基于 Java，广泛用于生物信息学，也可用于社交网络、知识图谱等通用网络分析。
核心功能
——网络导入与数据兼容
支持 SIF、XGMML、GraphML、CSV、TSV 等格式；可导入基因、蛋白互作数据；节点、边可挂载大量属性表格数据。
——可视化布局与美化
内置力导向、环形、分层等多种布局算法；自定义节点形状、大小、颜色、透明度；边样式粗细、颜色、透明度；支持边捆绑降低大规模网络视觉混乱。
——筛选、查询与选择
按属性过滤节点与边；搜索支持文本、数值范围查询；可圈选、套索工具批量选择节点子集，对网络做局部提取分析。
——统计分析
计算网络拓扑参数：度、介数中心性、聚类系数；表格视图查看全部节点 / 边属性；支持公式计算生成新属性列。
——扩展生态
内置 App Store，一键安装插件，富集分析、通路分析、高级布局、数据库对接等功能靠插件实现。
下载地址
https://pan.xunlei.com/s/VOpwSiC9mKsPgAUSEcf0SQS0A1?pwd=vecu#
安装教程
正文完
